苹果树最常见的病害有：斑点落叶病、腐烂病、轮纹病、病毒性缩果病、花脸病、花叶病等病害。造成这些病害的主要原因有：营养条件差，苹果果树负载超重，苹果果树环剥技术应用不当，整形修剪技术应用不当，病虫害防治不力、干旱、冻害等都会影响苹果树的健康生长。
防治方法：1,科学增施有机肥水，在苹果树的肥水管理中要密切关注果树的生长状况，并结合果树出现的早期病害症状，通过施加肥料或控制果园的给水、排水，提高树体的抗病虫能力。另外在秋冬季要对苹果树的枝叶进行修剪，合理施肥，翻耕除草。在果实收获后要对树木进行全面修剪，彻底清除发生病虫害的枝叶，并用石硫合剂、波尔多液等药剂全面喷施，降低病虫越冬基数。
2，推行果园生草法，在果园病虫害防治中，果园生草法是合理有效的土壤管理方法。生草法不仅使果园土壤机质得到增加，而且还可以招引苹果树病虫害的天敌，农药的用量得以减少，从而保证了苹果的品质与质量。果园生草法不仅为苹果树发生病虫害的天敌提供了良好的栖息之所，也为其提供了食物，招引并定居了果树的大量天敌。
3，合理使用化学方法，首先要对农药的品种与剂量严格控制，坚持用药的科学化。根据果树病虫害的防治对象，把单位面积上的用药剂量控制在最经济的范围内，同时，对用药方法还要注意，尽量减少对天敌的杀伤。如果使用生物农药和昆虫生长调节剂等环保农药。无公害果品生产使用一般有：华光霉素、阿维菌素、浏阳霉素等。
4，适量挂果，确定适量的留果量，才能确保稳产、丰产、均衡树势，增强树体抗病性。可采用距离疏花法或干周法确定留果量。如一般盛果期苹果每亩产量应控制在3000～3500公斤，根据单果重，元帅系品种(单果重250克)留果量为1.2万～1.4万个；富士系(单果重300克)留果量为1万～1.2万个。然后再根据每亩栽植株数，各株的生长情况，具体确定每株的留果数量。
5，实现病虫害预测网络管理，在果园的日常管理与养护中，不但要对提高果品质量安全意识加以重视，而且要逐步建立病虫害预测管理平台，应用现代电子监控技术，运用于日常管理中。首先将病虫害综合防治技术贯穿，实行以物理生物防治为主体，农药防治为辅助，这样就达到病虫害传播的同时避免了人为造成病虫害的几率。
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